黃巢死后，曾經(jīng)投降黃巢的蔡州節(jié)度使秦宗權(quán)的兵馬實(shí)力還不弱，他繼續(xù)走反唐朝的道路。但與農(nóng)民起義軍不同，秦宗權(quán)其實(shí)就是割據(jù)的藩鎮(zhèn)軍閥。
蔡州臨近朱溫的汴州，兩人的觀念不同，爭(zhēng)斗不可避免。當(dāng)時(shí)，中原一帶的軍閥還有時(shí)溥、朱瑄朱瑾兄弟，但這些人并沒(méi)有公開(kāi)反對(duì)唐朝廷。而朱溫表面上是服從唐朝廷的管轄，因此，朱溫當(dāng)時(shí)最直接的敵人是反唐的秦宗權(quán)。
秦宗權(quán)是蔡州上蔡人，早年為許州牙將。當(dāng)許州將官周岌在880年趕走忠武軍節(jié)度使薛能取而代之時(shí)，秦宗權(quán)也驅(qū)逐蔡州刺史并占據(jù)蔡州。
當(dāng)黃巢退出關(guān)中進(jìn)入河南后，蔡州的秦宗權(quán)被農(nóng)民起義軍打敗，秦宗權(quán)投降了黃巢。而黃巢在山東狼虎谷自殺后，秦宗權(quán)野心膨脹，把蔡州作為老巢，四出侵襲周?chē)某擎?zhèn)。
秦宗權(quán)為人殘酷，所占州縣都燒殺掠奪，百姓四處逃散，軍隊(duì)的后勤補(bǔ)給難以保障。
秦宗權(quán)的實(shí)力不弱，也沒(méi)把朱溫放在眼里。在884年七月，秦宗權(quán)主動(dòng)攻打宣武節(jié)度使朱溫。朱溫此時(shí)的勢(shì)力不強(qiáng)，就向天平節(jié)度使朱瑄求救（治所在鄆州）。
朱瑄派堂弟朱瑾帶兵前去援助，這個(gè)朱瑾作戰(zhàn)勇猛，在合鄉(xiāng)擊敗秦宗權(quán)的一支軍隊(duì)，為朱溫解圍。朱溫感謝朱瑄，尊他為兄，“三朱”也結(jié)成同姓兄弟。
由于亂世之秋，唐朝能號(hào)令的地方只有黃河西、山南、劍南、嶺南數(shù)十州，梟雄都在搶占地盤(pán)。
秦宗權(quán)派出軍隊(duì)搶掠鄰近各道各州，包括河陽(yáng)、許州、汝州、懷州、鄭州、陜州、虢州，東西南北四處作亂，所到之處燒殺搶掠。
秦宗權(quán)要求光州刺史王緒提供賦稅供養(yǎng)軍隊(duì)，王緒不能供給，秦宗權(quán)就發(fā)兵攻打王緒。
王緒沒(méi)有實(shí)力與秦宗權(quán)對(duì)抗，就調(diào)遣光州、壽州的五千軍士，裹挾著百姓渡過(guò)長(zhǎng)江，輾轉(zhuǎn)到江西的江州、洪州、虔州，還攻克了福建的汀州、漳州，最后在福建建立政權(quán)。
秦宗權(quán)趕走了光州刺史王緒后愈加猖狂，繼續(xù)往東攻掠潁州、亳州，但在亳州焦夷縣被朱溫打?。ń挂目h即夷父縣、城父縣）。
膨脹的秦宗權(quán)雖然沒(méi)有絕對(duì)的實(shí)力在中原稱(chēng)霸，但他還是迫不及待的在蔡州稱(chēng)帝（885年二月），并設(shè)置百官。
朝廷以（徐州）武寧節(jié)度使時(shí)溥為蔡州四面行營(yíng)兵馬都統(tǒng)，討伐秦宗權(quán)。
這年三月，秦宗權(quán)派他的弟弟秦宗言攻打荊南，并長(zhǎng)期圍困荊南。又派遣部將孫儒攻打東都洛陽(yáng)，東都留守李罕之與孫儒相持?jǐn)?shù)月，李罕之缺兵少糧，最終棄城向西逃到澠池。
孫儒占據(jù)東都洛陽(yáng)一個(gè)多月時(shí)間，大肆搶掠，并焚燒宮殿、官府、民房，洛陽(yáng)城已經(jīng)空虛，孫儒隨后率軍揚(yáng)長(zhǎng)而去。
孫儒離開(kāi)洛陽(yáng)后，李罕之在澤州召來(lái)張全義，收集散失的人馬。李罕之占據(jù)河陽(yáng)，張全義占據(jù)洛陽(yáng)，二人投靠河?xùn)|節(jié)度使李克用，請(qǐng)求李克用援助。
李克用任命部將安金俊擔(dān)任澤州刺史，安金俊帶領(lǐng)騎兵前往援助。李克用奏請(qǐng)朝廷任命李罕之為河陽(yáng)節(jié)度使、張全義為河南尹。
由于孫儒的殘酷暴行，洛陽(yáng)留下的是殘?jiān)珨啾?。張全義剛到這里時(shí)，百姓很少，無(wú)人耕種，到處都是廢墟。
張全義倒是一個(gè)好官，他貼出安民告示，召集逃難的流民，鼓勵(lì)百姓耕種，并進(jìn)行獎(jiǎng)勵(lì)，對(duì)破壞生產(chǎn)和治安的人進(jìn)行懲罰。（幾年后，這里又逐步熱鬧起來(lái)。）
在秦宗權(quán)軍隊(duì)的大肆進(jìn)攻下，臨近蔡州的二十多個(gè)州縣都被攻占。只有距離蔡州一百余里的陳州沒(méi)有攻下來(lái)。
陳州刺史還是那個(gè)趙犨，雖然兵力弱，但據(jù)城堅(jiān)守始終不投降，就像兩年前抵抗黃巢的軍隊(duì)一樣。他與朱溫聯(lián)姻，也得到了朱溫的援助。
唐僖宗獎(jiǎng)賞陳州刺史趙犨的忠勇能干，任命趙犨遙領(lǐng)蔡州節(jié)度使。
這年十月，秦宗權(quán)在八角鎮(zhèn)打敗了朱溫的軍隊(duì)。
到了第二年五月（886年），秦宗權(quán)的部將秦賢又侵?jǐn)_宋州、汴州，但被朱溫的軍隊(duì)在尉氏南部將其打敗。
七月，秦宗權(quán)又率軍攻打許州，武軍節(jié)度使鹿晏弘到此地沒(méi)多久，但在抵抗秦宗權(quán)的戰(zhàn)斗中被打敗了，鹿晏弘也被殺死。秦宗權(quán)占據(jù)了許州（許昌市）。
886年十二月，因（滑州）義成節(jié)度使安師儒管理不力，把軍政事務(wù)放權(quán)給部將夏侯晏、杜標(biāo)，引起了其他將領(lǐng)的不滿(mǎn)。
部將張驍率兩千軍士造反，攻打義成軍的官署滑州，安師儒被迫殺死夏侯晏、杜標(biāo)，平息眾怒。
而（鄆州）天平節(jié)度使朱瑄企圖控制義成軍，派他的堂兄弟、濮州刺史朱裕誘殺了張驍。
但沒(méi)想到的是，朱溫?fù)屜扰刹繉⒅煺?、李唐賓在雪夜突襲義成軍，架起一百多個(gè)云梯攻克了滑州城，俘獲了安師儒。朱溫就此接管義成軍，上奏請(qǐng)求以牙將胡真為留后。
而秦宗權(quán)的弟弟秦宗言圍攻荊南長(zhǎng)達(dá)兩年，守將張環(huán)在荊南頑強(qiáng)固守，糧食、武器都用完了，死尸到處都是。但秦宗言最后還是未能攻克荊南城，只好撤兵離去。
秦宗權(quán)的兵力數(shù)倍于朱溫，兩個(gè)軍閥經(jīng)常開(kāi)戰(zhàn)，各有勝負(fù)，朱溫不斷集小勝為大勝，消耗對(duì)方兵力，但秦宗權(quán)因不能打敗朱溫而感到恥辱。
887年二月，秦宗權(quán)想集中兵力攻打汴州。朱溫?fù)?dān)心自己的兵馬太少，派朱珍擔(dān)任淄州刺史，讓他招募一批軍隊(duì)回來(lái)，朱珍很快應(yīng)募一萬(wàn)多人。
四月，朱珍帶領(lǐng)招募的軍士回到汴州，朱溫很高興。此時(shí)，秦宗權(quán)集中兵力進(jìn)攻汴州，部將張晊（zhì）率數(shù)萬(wàn)人駐扎在汴州北郊，秦賢率數(shù)萬(wàn)人駐扎屯板橋，蔡州軍排列三十六個(gè)營(yíng)寨，相互連接二十余里，軍勢(shì)強(qiáng)盛。
朱溫對(duì)諸位將領(lǐng)說(shuō)：“秦宗權(quán)估計(jì)我們兵力少，又不知道朱珍已經(jīng)帶兵來(lái)到，以為我們害怕。我們要出其不意，先發(fā)制人?！?br/>
于是，朱溫親自領(lǐng)兵進(jìn)攻秦賢的營(yíng)寨，秦賢果然沒(méi)有防備，四座營(yíng)寨接連被攻克，一萬(wàn)多人被殺死。朱溫又派牙將郭言在河陽(yáng)、陜州、虢州一帶募兵一萬(wàn)多人歸來(lái)。
蔡州軍的將領(lǐng)盧瑭駐扎在中牟縣的萬(wàn)勝鎮(zhèn)，他在汴水兩側(cè)安置軍營(yíng)，以便斷絕汴州城的水路運(yùn)輸。
朱溫挑選精兵前去偷襲，當(dāng)時(shí)正好有大霧，朱溫的部隊(duì)悄悄到達(dá)盧瑭的軍營(yíng)，一陣掩殺過(guò)后，盧瑭的軍士猝不及防，落入水中而死的人非常多，盧瑭也投河自盡。
蔡州軍隊(duì)都轉(zhuǎn)移到張晊設(shè)立在北郊赤岡的營(yíng)寨，朱溫再次率軍前去攻打，又?jǐn)貧⒍f(wàn)余人。朱溫獲勝后暫回到汴州城內(nèi)，休養(yǎng)整頓軍隊(duì)。
887年五月初三，朱溫再次出兵與張晊的軍隊(duì)短兵相接，朱溫的手下聚集了葛從周等農(nóng)民軍投降過(guò)來(lái)的猛將，從清晨打到中午，蔡州軍又大敗。
秦宗權(quán)對(duì)失敗很氣憤，從鄭州前來(lái)與張晊的軍隊(duì)會(huì)合。朱溫見(jiàn)決戰(zhàn)在即，就向兗州、鄆州再次請(qǐng)求救援，朱瑄、朱瑾都帶領(lǐng)人馬前往，（滑州）義成軍也趕來(lái)參戰(zhàn)。
五月初八，朱溫指揮四個(gè)鎮(zhèn)的軍隊(duì)在汴州北郊邊孝村與秦宗權(quán)的軍隊(duì)決戰(zhàn)，蔡州軍因多次戰(zhàn)敗已沒(méi)有太強(qiáng)的戰(zhàn)斗力，被朱溫的軍隊(duì)斬殺兩萬(wàn)余人，秦宗權(quán)也趁夜間逃走。
汴州軍繳獲數(shù)不清的牛馬、輜重物品、武器鎧甲和俘虜，朱溫非常感激朱氏兄弟的幫助，把他們當(dāng)作親兄弟對(duì)待。
秦宗權(quán)兵敗如山倒，守護(hù)洛陽(yáng)、河陽(yáng)、許州、汝州、懷州、鄭州、陜州、虢州的蔡州軍士，得知秦宗權(quán)失敗后都紛紛逃走。。
秦宗權(quán)、張晊敗退至鄭州時(shí)，屠殺城內(nèi)的百姓泄憤，然后逃走。
朝廷任命扈駕都頭楊守宗接管許州，朱溫也奏請(qǐng)讓部將孫從益接管鄭州事務(wù)。