火影辦公室，宇智波鼬報告，“宇智波止水是宇智波一族中年輕人的中堅力量，他的自殺使得宇智波的士氣和戰(zhàn)斗力瞬間下降。”轉(zhuǎn)寢小春道，“就結(jié)果而言，還是扼殺了叛亂的萌芽??！”猿飛心痛不已，“難道止水也只能用自殺的方式來阻止他們嗎？是不是我把他逼得太緊了呢？”團(tuán)藏還在裝好人，其實(shí)他的右眼已經(jīng)換上了止水的寫輪眼，“貌似宇智波一族之中，有人是懷疑你殺了止水?！?br/>
鼬道，“我和止水一樣，所做的一切都是為了宇智波。只有不明白這一點(diǎn)的人，才會說出這樣的話。止水沒有出現(xiàn)在匯合地點(diǎn)！”鼬是在警告團(tuán)藏，團(tuán)藏也害怕事情敗露，“因?yàn)殡[藏的秘密受到懷疑嗎？讓暗部正式傳達(dá)止水自殺的消息吧！沒問題吧，猿飛？”猿飛同意了，他只是覺得事情有些蹊蹺。
晚上，南賀神社，宇智波鼬來到這里，再次觀看了祖?zhèn)鞯氖，F(xiàn)在擁有萬花筒寫輪眼，他看到了更多的內(nèi)容。
宇智波鼬繼續(xù)在暗部的生涯，某個夜晚，卡卡西帶領(lǐng)第六班的暗部忍者，與一群潛入森林的草忍進(jìn)行了激戰(zhàn)，宇智波鼬的幻術(shù)和手里劍大放異彩，一多半的草忍都是他解決掉的。這個時期，COPY忍者卡卡西的大名轟動忍界。為首的草隱上忍被卡卡西的雷切所殺。戰(zhàn)斗結(jié)束后，大和道，“前輩的大名流傳真廣?。 币粋€暗部道，“干了那么多年，當(dāng)然有名氣了。”卡卡西道，“處理現(xiàn)場，別留下任何與木葉有關(guān)的痕跡?！贝蠛偷?，“是、是，知道了。”
鼬道，“畢竟是在暗部，見不得光的任務(wù)是家常便飯。”戰(zhàn)斗結(jié)束后，大家在樹下休息。鼬道，“隊(duì)長你說過，你的寫輪眼是朋友托付給你的?！笨ㄎ鞯?，“連同他的意志?！摈?，“朋友的意愿，是不是非要回應(yīng)不可呢？”卡卡西道，“我個人認(rèn)為是的。宇智波止水的事情我知道，和這有關(guān)嗎？”鼬道，“不，沒什么?！笨ㄎ鞯?，“雖然幫不上太多的忙，但如果遇到什么難題，盡管開口?！摈饝?yīng)。
南賀河，宇智波鼬來到這里吊祭止水，“止水，自那之后，情況變得更加惡劣了。村子和宇智波我都保護(hù)不了啊！”
宇智波鼬加入暗部大約1年多了，木葉高層召見卡卡西與鼬。團(tuán)藏道，“隨著任務(wù)增加，現(xiàn)在決定增設(shè)暗部班，隊(duì)長就由鼬來擔(dān)任?！摈鴳?yīng)諾。小春道，“我不反對，不過你真年輕??！幾歲了？”鼬道，“13歲?！眻F(tuán)藏道，“有人成為上忍的時候，比他還年輕呢！”團(tuán)藏說的是卡卡西。門炎道，“進(jìn)暗部兩年就當(dāng)上隊(duì)長了?。 毙〈旱?，“是暗部隊(duì)長里最年輕的一個吧！”團(tuán)藏道，“新班的隊(duì)員，由我的暗部出人?！睆氖贾两K，猿飛都沒有說話，他的心情很沉重。
離開火影辦公室，卡卡西道，“你將被調(diào)去團(tuán)藏的暗部。”鼬道，“大概吧！”卡卡西提醒，“別被卷入上層的政治斗爭里?！摈白∫叩目ㄎ鳎f了類似訣別的話，“這兩年承蒙關(guān)照了！”卡卡西道，“你只是換個部門而已，照樣還是木葉忍者，又不是要離開這里?！?br/>
第三演習(xí)場，大和道，“他才13歲，真讓他擔(dān)任暗部隊(duì)長嗎？”卡卡西道，“畢竟他不是普通的忍者?！贝蠛偷溃凹幢銚碛袑戄喲?，13歲擔(dān)任隊(duì)長也是破格提拔了?！倍斕嬗钪遣a(bǔ)入第六班的人就是疾風(fēng)的戀人卯月夕顏。
雖然止水死亡，但宇智波一族叛變的步伐并沒有停下來。宇智波富岳召見了族中的中上忍，看著黑壓壓一片的高級忍者，富岳很滿意，“希望你們能服從命令！”眾人一起應(yīng)諾。富岳表情嚴(yán)肅，他知道這次政變成功的幾率不大，但事到如今，也只好鋌而走險了。
十三歲的宇智波鼬被任命為暗部的隊(duì)長，而實(shí)質(zhì)上是團(tuán)藏想要納為己用，鼬繼續(xù)向團(tuán)藏透漏著宇智波家族的情況。宇智波鼬面見團(tuán)藏，團(tuán)藏道，“我收到報告，警備隊(duì)正在強(qiáng)化武裝。這究竟是什么意思？”鼬道，“宇智波對村子的不滿再次升級了?！眻F(tuán)藏道，“不能再這樣下去了?！?br/>
火影辦公室，卡卡西參見火影，寬袍大袖的結(jié)界班班長卡柯伊也在那里。猿飛道，“木葉的結(jié)界系統(tǒng)你應(yīng)該知道吧？”卡卡西道，“就是那個能感知擅自入侵村子的人的系統(tǒng)吧？”猿飛道，“似乎有人突破了結(jié)界，幾次三番地進(jìn)入村子。”結(jié)界班長卡柯伊道，“穿過結(jié)界的暗號術(shù)式，在木葉只有一小部分人知道，可能是叛徒泄露了信息?；蛘叽嬖谟心芰忾_結(jié)界術(shù)式的忍者?！?br/>
猿飛道，“如果是叛徒，可以通過改變術(shù)式來排查。但我更愿意相信有忍者能穿過結(jié)界，雖然我也不想承認(rèn)。我要你去調(diào)查這件事！”結(jié)界班長卡柯伊將部分結(jié)界配置圖交給了卡卡西，“有些地區(qū)的反應(yīng)頻率很高。”其中反應(yīng)頻率高的地區(qū)就是宇智波的地區(qū)周邊?？乱恋?，“如果可以，我們也想在那邊設(shè)置結(jié)界系統(tǒng)。但那里是他們的自治區(qū)，所以沒法出手。”猿飛道，“行動時注意，別讓人發(fā)現(xiàn)是暗部在進(jìn)行調(diào)查?！?br/>
宇智波區(qū)的庭院，漩渦閃動，阿飛出現(xiàn)在那里，他戴著橘紅色夾雜黑色條紋面具，穿著黑色長袍。阿飛察覺有異，急忙空間瞬移消失。樹后，宇智波鼬戴著暗部面具出現(xiàn)。鼬非常細(xì)心，他對這個人的身份和能力感到十分震驚。
忍者學(xué)校，阿凱在遠(yuǎn)處觀察那些學(xué)生。鳴人正在向佐助挑釁，“聽著，我絕不會輸給你這種人的！”佐助沒好氣，“吊車尾一邊吵吵去！”兩人話不投機(jī)，吵成一團(tuán)。晶臧苦著臉在二人中間勸解。阿凱看得直搖頭，卡卡西走過來，“你怎么在這里？這時候來學(xué)校做什么？”阿凱道，“是這樣，我成了指導(dǎo)上忍。”卡卡西忍住笑，“你當(dāng)下忍的老師？”阿凱道，“是??！但說實(shí)話，我很不放心。不知道會負(fù)責(zé)什么樣的學(xué)生。”
學(xué)校操場，鳴人甩開晶臧，沖向佐助，“你別在那裝模作樣了，臭屁佐助！”佐助縱身一躍，躲開鳴人的偷襲，“你怎么那么煩人??！”鳴人跳腳，“閉嘴！”晶臧拼命從后面抱住鳴人，“笨蛋鳴人，不能打架?。∫留斂ɡ蠋焺倓偛盘幜P完……”鳴人大喊大叫，“放開我，晶臧！我要教訓(xùn)他！”
阿凱干笑兩聲，“這種學(xué)生的話，可能會很辛苦啊！”卡卡西搖頭，約上阿凱，“跟我來一下。”阿凱大喜，“怎么？要跟我切磋嗎？”
卡卡西與阿凱來到了宇智波地區(qū)，阿凱奇怪，“這是宇智波的防區(qū)啊！”卡卡西道，“街道可是別有一番風(fēng)情?。 卑P道，“我還是第一次進(jìn)來呢！”卡卡西道，“我來過幾次。以前……”阿凱看到了宇智波家的煎餅店，“的確是別有風(fēng)情小吃店?。 庇钪遣易迦陶哂貌挥押玫难酃庾⒁暥?，神經(jīng)大條的阿凱卻絲毫沒有注意到?？ㄎ魈ь^看到了宇智波帶土的故宅，露出了回憶的神色。
卡卡西記得，他們在波風(fēng)班時，他經(jīng)常來這里喊喜歡遲到的帶土。帶土的房間很整齊，他最喜歡做的事情就是偷偷親吻照片上的琳，當(dāng)然這種囧事不止一次被卡卡西撞破?？ㄎ骺偸钦f，“你這個笨蛋在干什么，集合的時間早就過了！”然后帶土惱羞成怒地大罵卡卡西……
卡卡西停留了一會兒，繼續(xù)向前走。阿凱叼著煎餅追上去，“這房子怎么了？”卡卡西道，“沒什么，想起了一個故人?！卑P道，“話說這煎餅真好吃??！沒白白跑這一趟?！笨ㄎ鞯吐暤?，“有些特產(chǎn)只有這個地方才有?！卑P道，“拜托了，快告訴我！”不少宇智波忍者在附近輪流監(jiān)視二人。
卡卡西與阿凱來到了南賀神社，阿凱道，“這是什么地方？”卡卡西道，“這是祭祀宇智波氏神的南賀神社?！卑P道，“我不信宗教。”卡卡西道，“別這樣說，要不要進(jìn)去抽個簽？”阿凱同意了，兩人向里面走去。
剛好宇智波鼬回來，遇到二人，“卡卡西隊(duì)長，你怎么在這里？”卡卡西道，“忽然回憶起了以前，你呢？”鼬道，“我是這里的人，經(jīng)常來?！笨ㄎ鲉柕?，“當(dāng)上隊(duì)長以后，還順利嗎？”鼬道，“沒什么改變，還是和以前一樣出任務(wù)?！笨ㄎ鞯?，“是嗎？”阿凱興高采烈跑出來，“卡卡西，是大吉呢！”鼬非常奇怪，不知道卡卡西來宇智波地區(qū)是什么任務(wù)，他并不相信卡卡西是懷念故人才來的。
離開宇智波自治區(qū)，卡卡西到火影辦公室報告，“無論入侵者是誰，憑現(xiàn)在的情報都還不足以摸清其目的。只能在部分結(jié)界系統(tǒng)分別配置人員，與結(jié)界班合作，一旦發(fā)生反應(yīng)便及時應(yīng)對。如果不使用這樣的人海戰(zhàn)術(shù)，想找出入侵者幾乎不可能?！痹筹w看完報告，“現(xiàn)在可沒辦法派這么多人手去做這種事情?！笨ㄎ鞯?，“只能請警務(wù)部隊(duì)加強(qiáng)巡邏了，只是……”
猿飛問怎么了，卡卡西道，“我好久沒去宇智波地區(qū)了，剛?cè)チ艘惶恕８杏X氣氛和以前大不相同，非常緊張。”猿飛嘆氣，“很封閉的感覺嗎？”卡卡西道，“是的，他們現(xiàn)在對外人的進(jìn)入似乎相當(dāng)排斥?！痹筹w道，“這樣啊，警務(wù)部隊(duì)的事情我會和高層商量，這任務(wù)到此為止吧！”
高層會議，團(tuán)藏道，“這是個好機(jī)會！以鞏固村子防御的名義，組建新的巡邏隊(duì)。將宇智波警衛(wèi)隊(duì)解任，削弱他們的戰(zhàn)斗力?！痹筹w道，“不，那樣會招來宇智波的激烈反抗，應(yīng)該讓警務(wù)隊(duì)來組建巡邏隊(duì)，反過來增加他們的職責(zé)?！眻F(tuán)藏道，“眼下必須扼殺政變的萌芽，怎么能反過來增加宇智波的戰(zhàn)斗力呢？”
猿飛道，“我不會讓宇智波發(fā)動政變。”團(tuán)藏惡狠狠道，“當(dāng)然了，他們別想得逞！”小春勸道，“你們都冷靜些，會不會發(fā)動政變，還是未知數(shù)。不如暫且靜觀其變吧！鼬不就是為了這個才協(xié)助我們的嗎？”
某日，宇智波一族再次前往南賀神社集合，族人們發(fā)現(xiàn)宇智波鼬依然沒有來，就有些懷疑。富岳只好說鼬有任務(wù)。其實(shí)鼬的任務(wù)就是監(jiān)視宇智波一族的動向，他就藏身在遠(yuǎn)處的樹叢中。而志村團(tuán)藏也悄悄潛入了宇智波地區(qū)，看到了這一幕。同時注意到這些的還有神秘莫測的阿飛。
事態(tài)緊急，宇智波鼬只好向上層報告，“宇智波一族已經(jīng)決定要在木葉發(fā)動革命。”小春嚇了一跳，“什么？”團(tuán)藏道，“你已經(jīng)掌握了證據(jù)吧？”鼬露出難過的神色，“是的?！笨ㄎ髡{(diào)查結(jié)界系統(tǒng)的結(jié)果顯而易見，這正是宇智波一族政變的前奏，而鼬的偵查也證實(shí)這一結(jié)果。
深夜，林中，阿飛出現(xiàn)在那里。宇智波鼬從樹上跳下來，喊住了他，“我需要你幫我個忙?！?br/>
第二天，猿飛與團(tuán)藏還在爭執(zhí)。團(tuán)藏道，“不能讓宇智波發(fā)動政變。唯獨(dú)在這一點(diǎn)上，你我應(yīng)該達(dá)成了共識吧？”猿飛的臉色蒼白，點(diǎn)了點(diǎn)頭。團(tuán)藏起身離開，猿飛急忙道，“等等，還沒有定論呢！”團(tuán)藏道，“既然宇智波做好了準(zhǔn)備，我們也必須做好準(zhǔn)備?！痹筹w嚴(yán)厲道，“記住，只能是準(zhǔn)備，團(tuán)藏！”團(tuán)藏冷笑一聲離去了，他才不會放棄這個千載難逢的好機(jī)會。