鵡川之戰(zhàn)，是上杉將軍家開幕以來的第一次對(duì)阿依努人發(fā)起的較大規(guī)模攻勢(shì)，戰(zhàn)后北海道各羈縻令制國(guó)中，除了石狩川流域的阿依努人部落以外，其余阿依努人部落紛紛選擇向上杉將軍家臣從，并主動(dòng)獻(xiàn)上人質(zhì)以及當(dāng)?shù)氐奶禺a(chǎn)——海狗腎、海瀨皮、鹿皮、熊皮等。
而這時(shí)的上杉謙信見天下基本泰平，便派遣山內(nèi)上杉家譜代家臣出身的大石芳綱上洛，向朝廷表面自己有將官位、一門總領(lǐng)等職盡數(shù)傳給上杉氏虎的想法。
與此同時(shí)，已經(jīng)開始接手上杉將軍家諸多政務(wù)的上杉氏虎則是異常的繁忙。因?yàn)樗谧鳛樯仙紝④娂抑陛犥妱?shì)進(jìn)行相關(guān)的改組，其中堅(jiān)力量則是作為上杉將軍家直屬家臣的旗本、御家人以及一萬石以上的譜代大名。
譜代大名與外樣大名明顯不一樣的是，他們具有強(qiáng)烈的上杉家譜代家臣意識(shí)，效忠的對(duì)象是主家而非主君一人。
由上杉將軍家旗本階層所構(gòu)成的直轄軍勢(shì)中，由番頭統(tǒng)率大番、書院番、小姓組、新番、小十人組，這五支常備軍勢(shì)合稱為「五番方」；還有徒組、百人組等構(gòu)成的徒步軍勢(shì)，以及由先手鐵炮組、先手弓組、槍組等持特定武器并接受物頭指揮的特科軍勢(shì)。
其中，大番是最早編成的常備軍勢(shì)之一，也是最基礎(chǔ)的騎馬武士，在上杉謙信正式以江戶城作為本據(jù)之際被編成了六個(gè)組（一組二十人左右）。而率領(lǐng)這支隊(duì)伍的大番頭最初大多是越后府中長(zhǎng)尾一族、越后上杉庶流、府中長(zhǎng)尾家的同族以及外戚所構(gòu)成的自越后以來的家臣。例如高梨義政（高梨政賴四男，高梨賴親之弟）、加地又三郎（上杉謙信姐夫加地春綱從兄）、千坂高信（千坂景親次男）、山本寺孝長(zhǎng)（山本寺景長(zhǎng)，山本寺定長(zhǎng)之弟）等人。
上杉將軍家還將江戶城西北近郊的麹町和市谷附近的臺(tái)地按家宅面積進(jìn)行劃分，建立起「番町」，并陸續(xù)在神田山、小川町等地建起屋舍，江戶十至二十里內(nèi)所謂「一夜宿」之地都被設(shè)置為知行地授予大番眾，他們負(fù)責(zé)加強(qiáng)對(duì)江戶城周邊的警備、在城中安排巡邏的同時(shí)，有時(shí)也隨從上杉謙信、上杉氏虎二人一道上洛。
原本，在上杉將軍家大老八條景定的協(xié)助下，上杉將軍家先后組建了左右虎捷軍、左右龍捷軍等常備軍勢(shì)，但隨著上杉將軍家所兼并的領(lǐng)國(guó)越來越多后，這些常備軍勢(shì)就需要被派往五畿八道的各個(gè)要害之地進(jìn)行常駐，以此來震懾才臣從不久的外樣大名們。例如小島貞興所節(jié)制的右虎捷軍兩千常備軍勢(shì)常駐于山城的普賢寺城；伯耆守護(hù)代福王寺孝重所節(jié)制的右龍捷軍兩千常備軍勢(shì)常駐于伯耆的八橋城；浦賀奉行長(zhǎng)尾景宗（長(zhǎng)尾彥丸，越后古志長(zhǎng)尾家庶流長(zhǎng)尾土左守婿養(yǎng)子，柿崎景家之子）所節(jié)制的左虎捷軍兩千常備軍勢(shì)常駐于上總八幡城（位于上總與下總兩國(guó)的境目地帶）；長(zhǎng)野正宣（準(zhǔn)一門格，上杉謙信養(yǎng)女婿長(zhǎng)野業(yè)盛之弟）所節(jié)制的左龍捷軍一千常備軍勢(shì)常駐于加賀的根上城。
左右虎捷軍、左右龍捷軍等常備軍勢(shì)原本就是從上杉謙信麾下的旗本先手役、段母衣眾、旗本御手廻眾等常備軍勢(shì)改組、擴(kuò)編而來。這些軍勢(shì)原本就長(zhǎng)期擔(dān)任上杉謙信的宿衛(wèi)以及負(fù)責(zé)本據(jù)周邊的警備，甚至還需要與上杉謙信同行。
隨著上杉將軍家達(dá)成天下靜謐，以及江戶城升格成為東都之后，上杉將軍家就需要填補(bǔ)負(fù)責(zé)宿衛(wèi)東都常備軍勢(shì)缺少的問題。
再加上大坂城、駿府城、春日山城、二條城等重鎮(zhèn)要地的改修完成以及被上杉將軍家逐漸直轄化，上杉將軍家還需要派遣一部分的常備軍勢(shì)進(jìn)行駐扎。
這就使得原本并不起眼的大番逐步發(fā)展成為在江戶城和大坂城、駿府城、春日山城、二條城等新直轄城池中負(fù)責(zé)護(hù)衛(wèi)的在番軍勢(shì)（大坂城兩組、駿府城一組、春日山城一組、二條城兩組）。當(dāng)初的六組大番在經(jīng)過上杉
謙信、上杉氏虎二人的多次擴(kuò)編后就增加到了十二組之多。
而且，由于在番部隊(duì)已經(jīng)離開將軍去守衛(wèi)城郭，維持原有的規(guī)則也變得困難。時(shí)任攝津守護(hù)代兼任大坂城代的千坂景親就對(duì)在番軍勢(shì)制定了相關(guān)規(guī)定，不僅禁止在番打架爭(zhēng)執(zhí)，還規(guī)定沒有番頭的許可絕對(duì)不可出城，不得入澡堂洗澡，不得與番眾以外的人往來，不得與在近畿諸國(guó)奉公的譜代大名、旗本、外樣大名等勾結(jié)。
另外，八條景定在離開東都前往京都之前，還為幕府新設(shè)置了兩個(gè)名叫書院番和小姓組的近衛(wèi)，負(fù)責(zé)護(hù)衛(wèi)將軍本人，也常常近侍于將軍、世子左右。
正所謂一代親兩代隔。
景定為了能讓上杉氏虎將來坐穩(wěn)征夷大將軍、武家棟梁之位，自然是不能對(duì)親藩大名百分百信賴的。只有進(jìn)一步加強(qiáng)將軍直屬力量，才能確保上杉將軍家的統(tǒng)治穩(wěn)如磐石。
之所以被稱之為書院番，是因?yàn)樗麄兂ｑv守在江戶城白書院的「紅葉之間」（先前曾常駐守于虎之間），小姓組則常駐于黑書院的「西湖之間」，因其庭前有片花田，也被稱為「御花田番」（明歷三年大火之后取代書院番居于「紅葉間」）。
在天正二年以后，上杉氏虎還設(shè)立了新番，因駐扎于江戶城的「土圭間」（后改為桐之間），因此得名「土圭間組」。
這些駐守在江戶城中的宿衛(wèi)軍勢(shì)是隨著大番開始在大坂城、駿府城、春日山城、二條城等直轄城池駐守而發(fā)展起來的，其主要構(gòu)成為原上杉謙信麾下的段母衣眾。
之后，這些宿衛(wèi)軍勢(shì)還被第二任將軍上杉氏虎分割再編為書院番六組、小姓組六組。此時(shí)，書院番頭（兼任小姓組番頭）是上杉氏虎年少時(shí)的近臣樋口兼續(xù)（樋口與六，樋口兼豐長(zhǎng)子）、色部長(zhǎng)影（色部勝長(zhǎng)之侄）、新發(fā)田盛喜（新發(fā)田重家之弟）等人來?yè)?dān)任。至于無法繼承旗本家業(yè)的次男和三男，則是被上杉氏虎進(jìn)行吸收，用于對(duì)書院番、小姓組、大番等軍勢(shì)進(jìn)行一定增強(qiáng)和再編。